Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ARL4CP56559 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARL4CP56559 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms