Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP4P49662 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP4P49662 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASP4P49662 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms