Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GCLMP48507 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms