Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGAEP38570 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGAEP38570 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms