Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJC1P36383 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GJC1P36383 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GJC1P36383 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms