Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPA3P35244 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPA3P35244 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPA3P35244 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPA3P35244 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPA3P35244 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPA3P35244 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPA3P35244 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPA3P35244 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA3P35244 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA3P35244 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA3P35244 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA3P35244 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA3P35244 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA3P35244 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA3P35244 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA3P35244 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA3P35244 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA3P35244 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA3P35244 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA3P35244 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA3P35244 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPA3P35244 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms