Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CXCR5P32302 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms