Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CASQ1P31415 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CASQ1P31415 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASQ1P31415 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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