Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
GCSHP23434 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
GCSHP23434 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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