Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PGA3P0DJD8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PGA3P0DJD8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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