Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEC24DO94855 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms