Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SAMD8Q96LT4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SAMD8Q96LT4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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SAMD8Q96LT4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SAMD8Q96LT4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SAMD8Q96LT4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SAMD8Q96LT4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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