Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GAB3Q8WWW8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GAB3Q8WWW8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms