Protein–RNA interactions for Protein: Q8N319

C6orf223, Uncharacterized protein C6orf223, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf223Q8N319 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C6orf223Q8N319 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms