Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms