Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TSSK4Q6SA08 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TSSK4Q6SA08 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms