Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CREB3L3Q68CJ9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms