Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RFTN2Q52LD8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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