Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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