Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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PMS2P3Q13401 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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PMS2P3Q13401 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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PMS2P3Q13401 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P3Q13401 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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