Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
APOBRQ0VD83 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APOBRQ0VD83 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms