Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEK3P51956 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEK3P51956 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEK3P51956 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEK3P51956 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEK3P51956 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEK3P51956 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEK3P51956 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEK3P51956 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEK3P51956 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEK3P51956 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEK3P51956 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEK3P51956 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEK3P51956 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEK3P51956 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms