Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJA4P35212 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GJA4P35212 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GJA4P35212 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GJA4P35212 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms