Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXC13P31276 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms