Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA4P06727 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms