Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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PDE6DO43924 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
PDE6DO43924 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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