Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP9BO43861 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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