Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HMX2A2RU54 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HMX2A2RU54 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX2A2RU54 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX2A2RU54 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX2A2RU54 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX2A2RU54 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX2A2RU54 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX2A2RU54 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX2A2RU54 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HMX2A2RU54 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HMX2A2RU54 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms