Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms