Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF275Q9NSD4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms