Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms