Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms