Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC83Q8IWF9 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC83Q8IWF9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC83Q8IWF9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC83Q8IWF9 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC83Q8IWF9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC83Q8IWF9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC83Q8IWF9 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC83Q8IWF9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC83Q8IWF9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC83Q8IWF9 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC83Q8IWF9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC83Q8IWF9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC83Q8IWF9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC83Q8IWF9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC83Q8IWF9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms