Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC8EQ6NSJ5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms