Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRMPD1Q5SYB0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms