Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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