Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
XRCC4Q13426 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
XRCC4Q13426 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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