Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTP4A2Q12974 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTP4A2Q12974 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms