Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABPB1Q06547 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms