Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN1Q04323 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN1Q04323 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms