Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF5P84085 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF5P84085 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF5P84085 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARF5P84085 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARF5P84085 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF5P84085 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF5P84085 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF5P84085 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF5P84085 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF5P84085 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF5P84085 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF5P84085 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF5P84085 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF5P84085 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF5P84085 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF5P84085 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ARF5P84085 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF5P84085 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARF5P84085 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms