Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GDF10P55107 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GDF10P55107 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GDF10P55107 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms