Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTGIRP43119 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTGIRP43119 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms