Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB2P29033 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB2P29033 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB2P29033 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB2P29033 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB2P29033 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB2P29033 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB2P29033 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB2P29033 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms