Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
GZMBP10144 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
GZMBP10144 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GZMBP10144 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GZMBP10144 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms