Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SCN2BO60939 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SCN2BO60939 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SCN2BO60939 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SCN2BO60939 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCN2BO60939 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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