Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLGNO14967 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLGNO14967 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms