Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERVW-1Q9UQF0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms