Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00523Q86TU6 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms