Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
KLHL22Q53GT1 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms